سیدمحمد خاتمی، رئیس جمهور پیشین ایران در پیامی، درگذشت آیتالله لطف الله صافی گلپایگانی را تسلیت گفت. او نوشت که رحلت این عالم بزرگوار، فقیه پارسا و مرجع عالیقدر، خسارتی است سنگین به ساحت علم و دین و اجتماع که لطف ویژه حضرت پروردگار میتواند آن را جبران کند.